冷冻式干燥机分类从不同角度，具有不同分类方式。

　　从冷冻式干燥机角度讲，即冷冻式干燥机的自身分类，按照不同的标准分类方式如下：

　　冷冻式干燥机按照规格的大小分为：台式冷冻式干燥机、小型冷冻式干燥机、中型冷冻式干燥机和大型冷冻式干燥机。

　　其中从搁板有效面积1～50m2已基本形成系列，其关键部件均能通过国际采购方式从国内外购买。习惯上，我们将1～ 10m2的冻干机称之为中型(生产型)冻干机;10～50 m2冻干机称之为大型(生产型)冻干机。而1 m2以下(如0.4 m2或0.6 m2)冻干机称之为实验型冻干机。台式和小型主要是应用于实验室，大中型主要是应用于工厂规模化生产等等。

　　按照式样可分为：经济型、普通型、压盖型和多歧管型。其中经济型和普通型主要是应用于一般的冷冻干燥，压盖型除了冷冻干燥外还具备真空包装的性能，多歧管型具有冷冻速度快，使用方便的特点。